泉州市眼科医院于2011年元旦在原泉州市儿童医院眼科中心的基础上成立，是目前我省单一一家国有公立眼科医院。原泉州市儿童医院眼科中心，是泉州市儿童医院和北京同仁医院协作成立的眼科专业诊疗机构，自97年以来已接诊眼病患者近100万人次，成功实施白内障、近视激光、斜视、青光眼、视网膜脱离等手术5万多台，使数万名眼疾患者重见光明。在市委市政府的大力支持下，建筑面积8000多平米，设计科学时尚、充满人文气息的现代化眼科大楼同时于2010年12月竣工投入使用。
医院拥有美国爱尔康公司较新一代珠峰和Infiniti超声乳化系统，由谢江斌主任医师、施瑜劲主治医师为主的白内障手术团队开展目前国际上最前沿的冷超乳及同轴微切口白内障手术技术，具有不疼痛、切口小不缝线、恢复快视力好等优点，已成功施行上万例手术，患者年龄从2个月~100岁，并开展了非球面、多焦点等人工晶体植入。医院拥有UBM、全自动视野计等先进设备，由全国著名青光眼专家林丁教授定期来泉会诊各种疑难病例，并开展各种抗青光眼手术，及建立青光眼患者俱乐部，举办健康讲座，从而使青光眼患者得到及时治疗并提高了自我管理疾病的能力。
医院耗资数百万元引进美国先进玻璃体手术设备、OCT、数码荧光眼底照相系统和眼内激光治疗仪，由吴松一博士和吕帆硕士配合同仁医院眼底专家开展玻璃体视网膜手术、眼底荧光血管造影和眼底激光治疗，使严重眼外伤、各种复杂的视网膜脱离、玻璃体出血等患者足不出省便可获得一流的诊治，并利用先进的Recam系统开展早产儿视网膜病变的筛查。
2012年医院投资千万巨资引进国际较先进的---德国ZEISS全飞秒激光手术平台，ZEISS VisuMax手术平台是福建省单一的一台全飞秒激光手术设备，与以往传统准分子激光治疗近视方法相比，其在安全性、个性化性、可控性等方面，都有质的飞跃。配合当今国际近视医疗领域中具有划时代意义的近视激光设备－全球少有激光公司美国科以人公司较新研发的鹰视酷眼Q-1.0版本准分子激光系统，由方一明主任和李晓霞硕士开展当今世界上较先进、安全的激光技术－SMILE全飞秒手术及Q值引导、角膜地形图引导的个体化角膜屈光手术，更好地实现广大近视患者追求更高视觉品质地愿望；而Q值调整老视矫正术的开展，为屈光不正老视患者带来了福音，减缓老视患者对老花镜的依赖。
医院设有专门的医学验光配镜中心，拥有价值数百万元的全自动磨边机、焦度计、综合验光仪、电脑验光仪等先进眼视光设备，由专业的眼视光医师对各种屈光不正患者进行规范的视光学检查和验配，满足患者清晰、舒适、持久的视力要求，并开展RGP及儿童视觉训练，有效减缓近视儿童度数的加深。医院还设有专业的斜弱视训练室，由金丽文主任医师领衔的学科团队利用动画、音频、视频等动态多媒体系统对斜弱视儿童进行视觉训练，改变了传统疗法单调、枯燥、乏味的状况，增加了手、眼、脑的协调配合能力，使弱视儿童的治疗由被动变主动，成功开展各种斜视手术数千例。
医院依托国内外专家团队强大的技术力量，对其它各种疑难眼病如角膜移植、眼部整形、眼肿瘤等各种眼疾患者的诊治提供著名眼科专家点名会诊手术服务。
医院的办院宗旨是本着“光明、奉献、爱心”的精神，提倡“求精、诚信、仁爱、和谐”的医院文化，以病人为中心，立足泉州，面向全省，走向全国，创国内一流眼科医院，竭诚为侨乡人民及海内外同胞提供一流的眼科诊疗服务。